A Itália, através de várias instituições e agências de desenvolvimento, mantém uma histórica colaboração com a UEM, apoiando a formação, investigação e modernização académica.

A Cooperação Italiana tem sido um parceiro estratégico da Universidade Eduardo Mondlane, contribuindo através do apetrechamento e funcionamento de unidades académicas, mobilidade académica, formação de quadros em diversas áreas, desenvolvimento e implementação de cursos de graduação e pós-graduação, estudos e projetos de pesquisa, apetrechamento de laboratórios e bibliotecas, reabilitação de infraestruturas tal como a recente reabilitação e modernização do Museu da História Natural em Maputo e aquisição de meios circulantes.